Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3AQ13472 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3AQ13472 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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