Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN3Q13286 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN3Q13286 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN3Q13286 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN3Q13286 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN3Q13286 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN3Q13286 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN3Q13286 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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