Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 27.49□□□□□ -1.218e-7■■■□□ 16.2
SRSF9Q13242 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.417e-7■■■□□ 16.2
SRSF9Q13242 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.837e-7■■■□□ 16.2
SRSF9Q13242 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 47.2□□□□□ -1.262e-8■■■□□ 16.2
SRSF9Q13242 NKD1-203ENST00000566396 748 ntTSL 38.58□□□□□ -1.043e-10■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 57.95□□□□□ -1.144e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 37.82□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 26.51□□□□□ -1.374e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 35.45□□□□□ -1.544e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 54.45□□□□□ -1.74e-7■■■□□ 16.1
SRSF9Q13242 NINL-202ENST00000336104 439 ntTSL 38.32□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 16
SRSF9Q13242 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.337e-22■■■□□ 16
SRSF9Q13242 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-6■■■□□ 16
SRSF9Q13242 CHRD-211ENST00000464833 1340 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 TRAF4-211ENST00000478021 718 ntTSL 313.99□□□□□ -0.177e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 313.97□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 211.75□□□□□ -0.536e-6■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-6■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 28.57□□□□□ -1.046e-6■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 511.18□□□□□ -0.623e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 310.73□□□□□ -0.693e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 210.16□□□□□ -0.783e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 29.31□□□□□ -0.923e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 36.6□□□□□ -1.353e-9■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 CCDC142-203ENST00000454193 2309 ntTSL 214.35□□□□□ -0.119e-7■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 CCDC142-206ENST00000473278 810 ntTSL 27.71□□□□□ -1.189e-7■■■□□ 15.9
SRSF9Q13242 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 45.76□□□□□ -1.494e-12■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 33.65□□□□□ -1.832e-8■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 23.46□□□□□ -1.864e-12■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 26.33□□□□□ -1.43e-6■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-6■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.39□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 15.8
SRSF9Q13242 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 510.19□□□□□ -0.787e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.197e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.327e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.597e-7■■■□□ 15.7
SRSF9Q13242 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.49e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.729e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.799e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.879e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.889e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.949e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.949e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-15■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 211.61□□□□□ -0.554e-11■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.914e-11■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 ACO2-204ENST00000471094 699 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 ACO2-207ENST00000482208 624 ntTSL 310.74□□□□□ -0.691e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 AP1G2-223ENST00000556277 891 ntTSL 510.28□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.861e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.922e-6■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.982e-6■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 ACO2-205ENST00000478010 644 ntTSL 28.13□□□□□ -1.111e-8■■■□□ 15.6
SRSF9Q13242 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RUVBL2-212ENST00000627972 1065 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 45.84□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 15.5
SRSF9Q13242 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 211.05□□□□□ -0.644e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 49.92□□□□□ -0.824e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 59.38□□□□□ -0.914e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 38.86□□□□□ -0.994e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -14e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 48.62□□□□□ -1.034e-8■■■□□ 15.4
SRSF9Q13242 CHRD-217ENST00000496527 588 ntTSL 413.98□□□□□ -0.178e-9■■■□□ 15.4
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SRSF9Q13242 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 512.7□□□□□ -0.387e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.477e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.637e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.697e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.737e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.757e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 29.95□□□□□ -0.827e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.077e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.327e-9■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.245e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 412.98□□□□□ -0.335e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 512.98□□□□□ -0.335e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 212.93□□□□□ -0.345e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.75e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.785e-12■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 54.6□□□□□ -1.671e-7■■■□□ 15.3
SRSF9Q13242 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 15.3
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