Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3BQ13214 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3BQ13214 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3BQ13214 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
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