Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
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