Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROAPQ12815 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TROAPQ12815 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TROAPQ12815 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TROAPQ12815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms