Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC8Q09428 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ABCC8Q09428 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ABCC8Q09428 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCC8Q09428 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ABCC8Q09428 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms