Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB2Q08289 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB2Q08289 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB2Q08289 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms