Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGM3Q08188 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGM3Q08188 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGM3Q08188 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms