Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRSF4Q08170 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF4Q08170 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF4Q08170 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms