Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FMODQ06828 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FMODQ06828 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FMODQ06828 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FMODQ06828 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FMODQ06828 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FMODQ06828 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FMODQ06828 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FMODQ06828 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FMODQ06828 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FMODQ06828 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FMODQ06828 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FMODQ06828 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FMODQ06828 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FMODQ06828 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms