Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC9Q06265 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC9Q06265 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
EXOSC9Q06265 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC9Q06265 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms