Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNB3Q05901 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB3Q05901 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms