Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF11Q05519 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF11Q05519 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF11Q05519 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms