Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN1Q04323 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN1Q04323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms