Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms