Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFHR1Q03591 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFHR1Q03591 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFHR1Q03591 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFHR1Q03591 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms