Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP2Q03169 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP2Q03169 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms