Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
TOP2BQ02880 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TOP2BQ02880 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
TOP2BQ02880 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TOP2BQ02880 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms