Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT1Q02742 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNT1Q02742 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT1Q02742 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms