Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC2Q02487 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSC2Q02487 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC2Q02487 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms