Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP4Q02446 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP4Q02446 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP4Q02446 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP4Q02446 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP4Q02446 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP4Q02446 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP4Q02446 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP4Q02446 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP4Q02446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP4Q02446 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP4Q02446 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP4Q02446 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP4Q02446 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP4Q02446 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP4Q02446 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP4Q02446 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP4Q02446 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SP4Q02446 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SP4Q02446 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP4Q02446 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SP4Q02446 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP4Q02446 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP4Q02446 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP4Q02446 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP4Q02446 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP4Q02446 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP4Q02446 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP4Q02446 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP4Q02446 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP4Q02446 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP4Q02446 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP4Q02446 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP4Q02446 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP4Q02446 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP4Q02446 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP4Q02446 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SP4Q02446 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP4Q02446 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP4Q02446 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP4Q02446 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP4Q02446 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms