Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP27A1Q02318 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYP27A1Q02318 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYP27A1Q02318 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms