Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN2Q02246 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNTN2Q02246 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTN2Q02246 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms