Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX6A2Q02221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A2Q02221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A2Q02221 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms