Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKB2Q00653 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms