Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3AP98173 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FAM3AP98173 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3AP98173 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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