Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VLDLRP98155 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VLDLRP98155 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VLDLRP98155 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms