Protein–RNA interactions for Protein: P82979

SARNP, SAP domain-containing ribonucleoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARNPP82979 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARNPP82979 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARNPP82979 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARNPP82979 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARNPP82979 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARNPP82979 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARNPP82979 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARNPP82979 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARNPP82979 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARNPP82979 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARNPP82979 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARNPP82979 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARNPP82979 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARNPP82979 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARNPP82979 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARNPP82979 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SARNPP82979 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SARNPP82979 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARNPP82979 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARNPP82979 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARNPP82979 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARNPP82979 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARNPP82979 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARNPP82979 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARNPP82979 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARNPP82979 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARNPP82979 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SARNPP82979 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARNPP82979 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARNPP82979 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARNPP82979 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARNPP82979 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARNPP82979 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARNPP82979 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARNPP82979 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARNPP82979 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARNPP82979 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARNPP82979 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARNPP82979 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARNPP82979 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARNPP82979 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARNPP82979 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARNPP82979 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARNPP82979 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARNPP82979 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms