Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRB1P82279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRB1P82279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRB1P82279 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRB1P82279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRB1P82279 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CRB1P82279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CRB1P82279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CRB1P82279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CRB1P82279 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRB1P82279 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRB1P82279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRB1P82279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRB1P82279 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRB1P82279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRB1P82279 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRB1P82279 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CRB1P82279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CRB1P82279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CRB1P82279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRB1P82279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRB1P82279 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRB1P82279 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRB1P82279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRB1P82279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CRB1P82279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CRB1P82279 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CRB1P82279 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CRB1P82279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRB1P82279 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRB1P82279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRB1P82279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRB1P82279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CRB1P82279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRB1P82279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRB1P82279 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRB1P82279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRB1P82279 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRB1P82279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRB1P82279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRB1P82279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRB1P82279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRB1P82279 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRB1P82279 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRB1P82279 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRB1P82279 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRB1P82279 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRB1P82279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRB1P82279 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CRB1P82279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CRB1P82279 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRB1P82279 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRB1P82279 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRB1P82279 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRB1P82279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRB1P82279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRB1P82279 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRB1P82279 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRB1P82279 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRB1P82279 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRB1P82279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRB1P82279 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRB1P82279 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRB1P82279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRB1P82279 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRB1P82279 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRB1P82279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRB1P82279 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CRB1P82279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRB1P82279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRB1P82279 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRB1P82279 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRB1P82279 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms