Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT85P78386 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT85P78386 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT85P78386 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT85P78386 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT85P78386 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT85P78386 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT85P78386 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT85P78386 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT85P78386 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT85P78386 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT85P78386 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT85P78386 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT85P78386 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT85P78386 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT85P78386 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT85P78386 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT85P78386 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT85P78386 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT85P78386 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT85P78386 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT85P78386 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms