Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SUMO1P63165 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SUMO1P63165 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms