Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL11P62913 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL11P62913 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL11P62913 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL11P62913 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL11P62913 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL11P62913 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL11P62913 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL11P62913 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL11P62913 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL11P62913 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL11P62913 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL11P62913 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL11P62913 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL11P62913 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL11P62913 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms