Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPS1P60891 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPS1P60891 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPS1P60891 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms