Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3EP60228 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3EP60228 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms