Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA3P59666 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEFA3P59666 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms