Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMDP57764 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GSDMDP57764 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms