Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCBP3P57721 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCBP3P57721 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms