Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A3P57103 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A3P57103 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A3P57103 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A3P57103 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A3P57103 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A3P57103 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1163.2 ms