Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN8P56748 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN8P56748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN8P56748 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms