Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN1P54253 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN1P54253 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN1P54253 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms