Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPAP53621 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPAP53621 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPAP53621 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPAP53621 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPAP53621 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPAP53621 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPAP53621 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPAP53621 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPAP53621 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPAP53621 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPAP53621 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPAP53621 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPAP53621 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPAP53621 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPAP53621 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPAP53621 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPAP53621 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPAP53621 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms