Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLCN3P51790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLCN3P51790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLCN3P51790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLCN3P51790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms