Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D1P51668 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms