Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAPOLAP51003 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAPOLAP51003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAPOLAP51003 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAPOLAP51003 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAPOLAP51003 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPOLAP51003 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLAP51003 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms