Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMDP50402 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMDP50402 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMDP50402 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMDP50402 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMDP50402 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMDP50402 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMDP50402 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMDP50402 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMDP50402 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMDP50402 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMDP50402 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMDP50402 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMDP50402 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMDP50402 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMDP50402 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMDP50402 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMDP50402 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMDP50402 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMDP50402 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMDP50402 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMDP50402 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMDP50402 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMDP50402 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMDP50402 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMDP50402 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMDP50402 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMDP50402 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMDP50402 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMDP50402 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMDP50402 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMDP50402 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMDP50402 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMDP50402 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms