Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARS2P49590 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARS2P49590 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARS2P49590 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HARS2P49590 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HARS2P49590 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HARS2P49590 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HARS2P49590 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARS2P49590 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARS2P49590 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARS2P49590 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HARS2P49590 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HARS2P49590 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HARS2P49590 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HARS2P49590 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HARS2P49590 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HARS2P49590 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARS2P49590 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HARS2P49590 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HARS2P49590 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HARS2P49590 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HARS2P49590 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HARS2P49590 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARS2P49590 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARS2P49590 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HARS2P49590 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARS2P49590 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HARS2P49590 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARS2P49590 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARS2P49590 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HARS2P49590 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HARS2P49590 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms