Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-211ENST00000637247 1468 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-210ENST00000637079 1634 nt18.77■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 LRRC29-207ENST00000462169 778 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 58.4
AARSP49588 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 58.3
AARSP49588 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 58.2
AARSP49588 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 58.2
AARSP49588 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 58.2
AARSP49588 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.355e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.835e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.475e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 318.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 57.1
AARSP49588 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.114e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 56.8
AARSP49588 SLC39A10-204ENST00000418005 563 ntTSL 424.79■■□□□ 1.562e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-208ENST00000464301 571 ntTSL 416.7■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 515.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 56.7
AARSP49588 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-207ENST00000458054 593 ntTSL 49.83□□□□□ -0.842e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-203ENST00000412905 337 ntTSL 39.13□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.08□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 25.95□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 45.32□□□□□ -1.562e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.842e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.972e-10■■■■■ 56.7
AARSP49588 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 56.4
AARSP49588 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.888e-7■■■■■ 55.4
AARSP49588 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.858e-7■■■■■ 55.4
AARSP49588 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 55.4
AARSP49588 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 318.22■□□□□ 0.518e-7■■■■■ 55.4
AARSP49588 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 316.94■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 55.4
AARSP49588 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 54.9
AARSP49588 CALN1-205ENST00000431984 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 54.9
AARSP49588 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 54.9
AARSP49588 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 54.9
AARSP49588 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 54.8
AARSP49588 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 521.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 316.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 54.6
AARSP49588 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.466e-14■■■■■ 54.2
AARSP49588 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.156e-14■■■■■ 54.2
AARSP49588 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.146e-14■■■■■ 54.2
AARSP49588 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-14■■■■■ 54.2
AARSP49588 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.736e-14■■■■■ 54.2
AARSP49588 AKAP10-207ENST00000572341 559 ntTSL 417.46■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-208ENST00000576896 565 ntTSL 417.42■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-205ENST00000571858 564 ntTSL 417.42■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-206ENST00000572155 578 ntTSL 416.56■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-210ENST00000582611 1319 ntTSL 516.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-207ENST00000474314 816 ntTSL 516.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.322e-12■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-211ENST00000494963 885 ntTSL 511.38□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 27.33□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 56.27□□□□□ -1.418e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MTF2-206ENST00000473430 760 ntTSL 55.54□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 54.1
AARSP49588 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.293e-6■■■■■ 54
AARSP49588 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 326.62■■□□□ 1.853e-6■■■■■ 54
AARSP49588 CHMP1A-207ENST00000549328 1003 ntTSL 320.27■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 54
AARSP49588 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 54
AARSP49588 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 54
AARSP49588 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 54
AARSP49588 CHMP1A-206ENST00000549139 812 ntTSL 216.94■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 54
AARSP49588 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.279e-29■■■■■ 53.7
AARSP49588 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC11.24□□□□□ -0.619e-29■■■■■ 53.7
AARSP49588 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.61□□□□□ -1.679e-29■■■■■ 53.7
AARSP49588 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 53.5
AARSP49588 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 12e-6■■■■■ 53.5
AARSP49588 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 53.5
AARSP49588 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 419.11■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 53.2
AARSP49588 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 53.2
AARSP49588 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 53.2
AARSP49588 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 52.8
AARSP49588 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 312.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 52.7
AARSP49588 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)26.63■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 52.5
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 18.8 ms