Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC11A1P49279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC11A1P49279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC11A1P49279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC11A1P49279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms