Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM4P49221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM4P49221 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM4P49221 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM4P49221 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM4P49221 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM4P49221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM4P49221 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM4P49221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM4P49221 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM4P49221 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM4P49221 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM4P49221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM4P49221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TGM4P49221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TGM4P49221 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGM4P49221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGM4P49221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGM4P49221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms